Κοροναϊός : Νέα δεδομένα για τη μετάλλαξη του – Ίσως είναι ανασυνδυασμός δύο ειδών

Νέα στοιχεία σχετικά με την εξέλιξη του κοροναϊού, δίνει μελέτη ερευνητών των Ινστιτούτων Πληροφορικής και Μοριακής Βιολογίας & Βιοτεχνολογίας του ΙΤΕ που δημοσιεύθηκε πρόσφατα.

Όπως αναφέρεται στη σχετική ανακοίνωση, η τρέχουσα πανδημία Coronavirus 2019 (COVID-19) προκαλείται από τον ιό SARS-CoV-2, και εξακολουθεί να εξαπλώνεται ραγδαία σε όλον τον κόσμο.

Κρίσιμη η κατανόηση της εξελικτικής πορείας του

Η υπολογιστική ανάλυση του DNA 1.800 δειγμάτων SARS-CoV-2, επιτρέπει να κατανοήσουμε με ακρίβεια την πρόσφατη εξελικτική του πορεία και τους μηχανισμούς προσαρμοστικότητάς του, καθώς δεν υπάρχει ακόμη αποτελεσματική θεραπευτική ούτε και προληπτική στρατηγική.

Αυτή η μελέτη αποσκοπεί στην κατανόηση φαινομένων όπως ο γενετικός ανασυνδυασμός, ο ρυθμός μετάλλαξης και γεγονότα προσαρμογής στο γονιδίωμα του SARS-CoV-2 που μπορεί να συνέβαλαν στην εξέλιξή του.

Τα αποτελέσματα της μελέτης υποδηλώνουν ότι το γονιδίωμα του κορονοϊού του παγκολίνου μπορεί να έχει συνεισφέρει στο γονιδίωμα του SARS-CoV-2 μέσω ανασυνδυασμού του με το γονιδίωμα του κορονοϊού της νυχτερίδας.

Επίσης, εντοπίστηκαν ενδείξεις και για ανασυνδυασμό με κορονοϊούς άλλων ειδών, όπως πχ στον σκαντζόχοιρο και το σπουργίτι που ενδεχομένως έχουν συμβεί στο παρελθόν και έχουν επηρεάσει την εξέλιξη του SARS-CoV-2.

Εντοπίστηκαν επίσης στόχοι φυσικής επιλογής, δηλαδή τοποθεσίες στο γονιδίωμα που ενδεχομένως έχουν συμβάλει στην μεγαλύτερη ικανότητα επιβίωσης και διάδοσης του ιού.

Παρόλο που τα συμβάντα ανασυνδυασμού σε ανθρώπινους ξενιστές δεν μπορούν να εκτιμηθούν άμεσα, λόγω της μεγάλης ομοιότητας των γονιδιωμάτων SARS-CoV-2, συνάγεται, με τη χρήση ανάλυσης ανισορροπίας σύνδεσης, ότι ανασυνδυασμοί ενδέχεται να έχουν συμβεί πρόσφατα και σε ανθρώπινους ξενιστές.

Οι ερευνητές στη μελέτη τους εκτίμησαν και τις παραμέτρους ενός δημογραφικού σεναρίου, όπως αναφέρεται, κατά το οποίο λαμβάνει χώρα υποθετική εκθετική αύξηση των πληθυσμών SARS-CoV-2 που έχουν μολύνει ευρωπαϊκές, ασιατικές και βόρειες αμερικανικές ομάδες, και αποδείχθηκε ότι μια ταχεία εκθετική αύξηση του μεγέθους του πληθυσμού SARS-CoV-2 μπορεί να δικαιολογήσει τον παρατηρούμενο πολυμορφισμό στα γονιδιώματά του.

«Η μελέτη αυτή, πέρα από τα καινούρια ευρήματα που παρουσιάζει, μπορεί να συνεισφέρει και στην ορθότερη κατανόηση των συσχετίσεων των ιικών γονιδιαμάτων με τη σοβαρότητα της νόσου και την αλληλεπίδραση με το DNA του ανθρώπου» καταλήγει η ανακοίνωση.

Η μελέτη δημοσιεύθηκε στο επιστημονικό περιοδικό bioRxiv με τίτλο «Population genomics insights into the recent evolution of SARS-CoV-2» ενώ μέλη της Ερευνητικής Ομάδας είναι οι ερευνητές Παύλος Παυλίδης (ΙΤΕ), Μαρία Βασίλαρου (ΙΤΕ), Απόστολος Μπελούκας (ΠΑ.Δ.Α), Νίκος Αλαχιώτης (ΙΤΕ) και Ιωάννα Γαρεφαλάκη (ΙΤΕ)

 

---